桜島の噴火

今回のニュース（噴火による避難指示：レベル５）は思わず長いこと見てました。

桜島は私の故郷で、小学校卒業まで住んでいました。今回避難対象になっている南東部とは反対側です。桜島の北西側は観光やフェリー、農産物（みかんや桜島大根など）で収益を上げている豊かな村でした（溶岩が多い南東側は1950年に鹿児島市に編入されていたが、こちらは独立を保っていた）。夏休みは毎日、家から５分の海で泳いでいたし、ハネムーン客も大勢泳ぎに来ていました。好調な財政を反映してか、小中学校の校舎も立派でした。私が10才の時に西桜島村から桜島町に昇格、町中でお祝いしました（新しいフェリーも就航）。

噴火はほぼ毎日で慣れっこでしたが、農産物が全滅して村内運動会が中止になったことも。大正３年の大噴火の記念日 (1月12日) には全島脱出を想定した避難訓練が毎年ありました。当時は大噴火の経験者が存命で、噴火しないという測候所の予測を信じて避難しなかった人が犠牲になったという話を聞いた記憶があります。

桜島町は2004年ついに鹿児島市に編入。私が通った当時360名いた小学校も今では20名ほどの複式学級だそうです。でも頑張っている様子がHPから伝わってきて、心の中で応援しています。

私の苦労話 Part 4: 完全にES細胞由来の腎臓高次構造を構築 (2022.2.1)

 2022.2.1にNat Communに論文を発表し、その裏話を発生研HPに掲載しました。

http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/bunya_top/kidney_development/#1

遅くなりましたが、その転載です。

西中村教授の苦労話 Part 4: 完全にES細胞由来の腎臓高次構造を構築 (2022.2.1)

 

　2022年2月1日 Nature Communications誌に論文を発表しました。腎臓はネフロン前駆細胞、尿管芽、間質前駆細胞という３つの前駆細胞から形成されます。私たちは2014年にネフロン前駆細胞の、2017年に尿管芽の誘導法を報告してきました が、今回は最後のピースである間質前駆細胞を誘導したという論文です。2017年の論文では、間質前駆細胞が誘導できていなかったのでマウス胎仔由来の間質前駆細胞で代用していました。今回は、それをマウスES細胞から誘導する方法を開発し、同じくES細胞から誘導した残り二つの前駆細胞（ネフロン前駆細胞及び尿管芽）と組み合わせることで、ES細胞のみから、多数に分岐した尿管芽の周囲にネフロンが配置された腎臓本来の高次構造を再構築したものです。これほど複雑な臓器の構造が試験管内で作れるということは、理論的にはヒトでも同様の構造が作れることになります。

　このプロジェクトは2017年に、田中さんが大学院に入学した頃に始動しました。尿管芽の誘導法を開発して論文にまとめつつあった太口さんによる猛特訓が始まりました。発生初期のマウスを解剖してFACSし、それを培養して間質前駆細胞に誘導できているかを確認するという初心者には極めてハードルの高い実験です。しかも太口さんは数ヶ月後に留学するということで、それまでの独り立ちを目指しての短期集中特訓となりました。田中さんはこれによく耐えて成長し、その後も毎回10匹近いマウスを交配して実験を繰り返し、マウス胎仔からの誘導条件を決めてくれました。

　この際に重要な役割を果たしたのが、間質前駆細胞やその起源である後方中間中胚葉での遺伝子発現です。これが当時ほとんどわかっていなかったため、シングルセルRNA シークエンスを立ち上げました。発生研としても初めての挑戦だったのでわからないことだらけでしたが、田中さんと谷川さんの尽力でとても質の良いデータが得られました。この膨大なデータをバイオインフォーマティクスを駆使して解析する必要があるわけですが、そんなことを全くやったことがない小林さんと三池さんがみるみるうちにマスターしてくれました。本人たちも驚いていましたが、こういったドライの研究に向いた才能を元々持っていたことになります。彼らが初心者の私でもわかるくらいにデータを処理してくれました。

　これらを基にして、谷川さんがES細胞からの誘導に挑戦しました。間質前駆細胞の難しさは、それだけでは特徴的な形態をとらないことです。結局３つの前駆細胞を混ぜてみて腎臓の高次構造ができるかで判定するしかありません。しかも誘導した３つのうちどれかの調子が悪いと決してうまくいきません。谷川さんはひたすら誘導を繰り返し、田中さんや大森さん、井上さんと協力しながら誘導条件を最適化してくれました。そうしてようやくES細胞だけから構成される腎臓の高次構造が実現できたわけです。しかも谷川さんと大森さんはさらにマウスへの移植を繰り返して、どこまで成熟するかをシングルセルRNA シークエンスで調べたわけです（三池さんがここでも活躍）。

　このように、今回の論文は５年かけて全員で成し遂げた力作です。関わった全ての皆様に深く感謝いたします。ちなみにこの論文は田中さんの学位論文にもなります。Nature Communicationsのeditorから、”Wow, what a great project to finish a PhD with!” というメールをもらったことは嬉しいエピソードです。

　今後はヒトiPS細胞から間質前駆細胞を誘導します。あと２つの前駆細胞は既にできている（苦労話 Part 2&3参照）ので、３つ目を誘導してヒトで腎臓の高次構造を作ります。さらに尿管という尿の排出路を作れば、機能するヒト腎臓がすぐそこです。自分の結婚式の時に「新郎は腎臓を作ろうなどという冗談みたいなことを考えています」という祝辞をいただき、場内が笑いに包まれた時から長い年月がたちましたが、ここまで来ることができました。私がラボメンバーの結婚式で「新郎（新婦）は腎臓を作ろうとしています」と祝辞を述べても笑う人はもういません。みんなありがとう。もう一息です。

熊本地震から5年 (2021.4.14)

 

発生研HPに掲載したものです。

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2016.4.14の熊本地震から５年になります。亡くなった多くの方々のご冥福をお祈りします。

皆様のおかげで発生研は復旧し、さらに飛躍を目指しています。

新しく設置した機器の固定もお忘れなく(下記マニュアル参照）。

 

http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/saigai/

火災対応

地震対応

研究機器固定法

 

コロナ対策を守りつつ、地震や火災への注意も怠らないようお願いします。特に火災は地震より高い頻度で起き、地震の際に火災が発生することも多々あります。非常時には周りに誰もいないかもしれません。その場合、あなたに全てがかかっています。消防／救急への連絡、初期消火、救護、館内放送で避難周知、などの対応をお願いします (地震の時には電源や都市ガス・炭酸ガスの閉鎖も）。並行してメールアドレス <all-imeg(at)kmm.kumamoto-u.ac.jp> を使って全員に（建物外にいるメンバーにも）状況を知らせてください。

このアドレスは、熊本地震の際に迅速な情報共有ができなかった反省から作られたもので、発生研の方は誰でも全員に向けて発信できます（センター事務にも届きます）。リストはリゾンラボが常に更新しています。平時にも気軽にご利用ください。

 

参考：熊本地震関連トピックス

http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/saigai/

Five years since Kumamoto Earthquakes (2021.4.14)

 

It has been five years since the Kumamoto Earthquakes in 2016.

We thank you all for your great contributions to the restoration of our institute.

 

Always be prepared for earthquakes and/or fires, in addition to COVID-19. Please read the manuals in the following URL.

http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/en/saigai/

Fire

Earthquake

 

In an emergency, you may find no one around you. If so, you should take care of everything, including emergency calls, initial fire fighting, rescue of the injured, announcement for the remaining members the building, (and closure of the gas/electricity in the case of earthquakes). Also mail to the all-imeg address <all-imeg(at)kmm.kumamoto-u.ac.jp>, so that you can share the information with all the IMEG members.

所長退任のご挨拶

日頃より熊本大学発生医学研究所へのご支援ありがとうございます。お陰様で本研究所は着実に前進しています。2016年以降３人の独立准教授が着任し、研究室が増えました。今年２月にはその一人である石黒啓一郎准教授のグループが、体細胞分裂から減数分裂へのスイッチを制御する遺伝子を発見して論文を発表しました (Developmental Cell, 2020)。発生学の基盤となる業績であり、不妊の原因に関わる遺伝子として新聞等でも報道されました。現在、さらに研究室を２つ増やすべく、全国公募を行っています。新しい才能が研究所に加わることを楽しみにしています。今年は発生研設立20周年でもあります。1939年に設置された体質医学研究所を原点とし、複数回の再編を経て2000年に発生医学研究センターとして設立されました（2009年に発生医学研究所に改組）。今後も発生医学の拠点として活動していく所存です。

さて私事ではありますが、本年3月末日をもって２期４年の任期を満了し、所長を退任することとなりました。着任直後 (2016年4月14日) の熊本地震の際には、全国の皆様から多大なご支援をいただきました。当時の激励メールや寄附名簿をみるたびに思いを新たにします。ここまで発生研が回復できたのも、また自分がここまで頑張れたのも、皆様のご支援のおかげです。本当にありがとうございました。一方で、コロナウイルスの感染が拡大しており、地震に始まりコロナで終わる所長ということで、被害を最小限に抑えるべく緊張した日々が続いています。

この４年間には所長業務の傍、腎臓の高次構造の試験管内再構築、患者由来のiPS細胞による遺伝性腎臓病の再現、腎臓前駆細胞の増幅法などの成果を論文発表し、メディアでも報道していただきました。しかし機能する完全な腎臓を作るには解決しなければならないことがまだ多くあります。４月からは副所長として新所長をサポートしつつ、研究により多くの時間を割くつもりです。世界の誰も見たことがない、自分にしか見えない景色が時々見えるのが研究の醍醐味ですし、未来の医療にも繋がります。さらに挑戦を重ねて、世界と自分自身の想像を超えていきたいと思っています。今後も発生医学研究所をよろしくお願いいたします。

2020年3月

熊本大学　発生医学研究所
西中村　隆一

熊本地震から３年 2019.4.16

発生研の全メンバーに送ったメールです。
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2016.4.14 & 4.16の熊本地震から３年が経ちました。大変な経験をしましたが、おかげさまで発生研は完全に復旧し、未来のサイエンスに向けて進んでいます。皆様のご尽力に深く感謝いたします。

もちろん油断は禁物なので、新たに購入した機器の固定などお忘れなく。このアドレス は発生研全員 (センター事務含む）にメールを送ることができるので、緊急時に使ってください。通常時でも全員に連絡したい時に使って結構です（普段使ってないといざという時に動かないので）。

地震で亡くなられた270名以上の方々のご冥福を祈りましょう。

西中村 隆一


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まだ日奈久断層にひずみが残っているという九大の報告もありますので、機器の固定はしっかりお願いします。発生研HPに固定法の具体例があります。
http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/kotei2016oct/

地震、火災の際に、所長や教授がいつもいるわけではありません。その場に居合わせたメンバーで全所内の怪我人や火事、電源、都市ガスと炭酸ガスへの対応をお願いします。その上で、このアドレスを使って全員に情報を共有ください。具体的手順は下記サイトにあります。被害がないという報告もありがたいです。
http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/saigai/

災害が起こって停電するとWEB情報は見えません。ですから災害対応マニュアルは今日printoutして、よく使うカバンに入れておいて下さい（私は東北地震以来そうしていて熊本地震のときに役立ちました）。

黒髪キャンパスのメールサーバーが損傷あるいは停電すると、このアドレスも含めて熊大のメールすべてが動かなくなります。しかし地震当時、gmailやLINEは動きました。backupの連絡網をラボ毎に構築ください。

西中村

令和を迎えるにあたって (2019.4.1)

（発生研HPに新年度の所長挨拶として掲載したものです）

2019年度が始まりました。新しい元号が発表されたので、5月からは令和初年度と呼ばれるのでしょうか。

思い起こせば、昭和が終わって平成が始まった日は大雪でした。私は研修医２年目で、栃木の病院にずっと泊まり込んでいました。あれから30年、まさか医者をやめて熊本で研究をしているとは予想もしませんでした。まだ医者の訓練中だった人間が、腎臓内科医として働いたあと、がむしゃらに実験して研究の面白さを知り、ラボを持ち、仲間に恵まれて腎臓がかなり作れるところまでこぎつけました。この30年の間に、PCRやDNA抽出キットが一般化し、ES細胞を使ってノックアウトマウスが作られ、ヒトゲノムが解読され、iPS細胞が樹立され、臓器の遺伝子発現が１細胞レベルでわかるようになりました。e-mailとインターネットが出現し、論文の電子化が進み、スマホでどこからでも大量の情報にアクセ スできるようになりました。驚くべき進歩です。

これからの30年でどんな進歩が起きるのでしょうか。おそらく想像さえできないことが実現されるのでしょう。高度に発達した科学技術は魔法と見分けがつかない (Any sufficiently advanced technology is indistinguishable from magic)、とアーサー・C・クラークは言っています。不可能を可能にする、それを実現するのは若いあなた自身です。自分の想像を超える可能性を試してください。そして自分が一生かけて解きたいことを見つけてください。先輩として喜んでお手伝いします。発生研の研究環境はコンパクトかつ充実しています。考えつく大抵のことはできますし、さらにやりたいことがでてきたら手を尽くして実現できるようにしています。そうやってみんなで成長してきましたし、それが発生研の原動力となっています。世界の誰も見たことがない、自分にしか見えない景色を見てください。もちろん私も完璧な腎臓作製に向けてさらに挑戦し、自分自身と世界の想像を超えていきたいと思っています。

発生研の現在及び未来のメンバーの奮闘と幸運を祈ります。我々を応援してくださっている方々には、これからもご支援・ご指導のほどよろしくお願いいたします。

熊本大学発生医学研究所　所長　　西中村　隆一

Let's start with calamari

昨年(2018年)４月に恩師である新井賢一先生が亡くなられました。追悼文集の一部です。

Let’s start with calamari

          　　　熊本大学発生医学研究所　教授・所長　西中村　隆一

　　 　　　 Ryuichi Nishinakamura, Kumamoto University, Japan　　　　　　　　　　　　　　　　　

　初めて東大医科研の新井賢一先生を訪ねたのは1990年末でした。真冬にも関わらず半袖短パンの人物が「今日は暑いですな」と言いながら現れて、３時間しゃべり続け、それが終わる頃には私は新井研に入ることになっていました。

　新井先生との接点が増えたのは、医科研にいるときよりも、むしろ1993年から２年間DNAX研究所に留学させてもらった時でした。新井先生はDNAXに来るたびに我々若手をSundanceというステーキレストランに連れ出し、散々ご馳走してくれました。最初は必ず ”Let’s start with calamari.”  イカリングのフライです。それからShrimp　cocktailなど色々頼んで結構お腹が膨れてきたところで、Prime rib steak。私が普通サイズを注文していると、横から「一番大きいやつにしてくれ」と勝手に変えてしまい、「若いんだからこれくらい食べんといかん」。サイエンスの話はほとんどした記憶がなく、楽しい日々でした。

　　帰国して、東大医科研のAMGEN寄付講座（新井先生が設立に尽力）に加入。サイトカインから離れて腎臓の研究を始めました。ノックアウトマウスで腎臓発生を解き明かして、それをもとに腎臓を作ってみたいと伝えると、「それは面白い、ノックアウトではなくて作るというのがよい。是非やれ」と励ましてもらいました。しかし、カエルとマウスを使って腎臓発生に関わる遺伝子を３年間必死に探したものの、全くうまくいかない。あきらめてサイトカイン研究に戻ろうかと思って相談すると、「おまえは腎臓の発生をやるんじゃなかったのか。他人の芝生が青いからといってそっちにひょろひょろいくのか。」と叱られました。「他人のフェロモンに引き寄せられてよそへ行ってしまうのではなくて、ここできちんとデータを出して、自分のフェロモンを出して、他人を自分のところに引き寄せられるようになれ。お前はそうなれるはずだ。」この最後の「お前はそうなれるはずだ」というところが新井先生の人たらしなところで、そんな無茶なと思いながらまた踏ん張ってしまうんですよね。その甲斐あって、新しい遺伝子がとれて腎臓のないマウスができ、その知見をもとに、腎臓組織をヒトiPS細胞から作ることができるようになってきました。ここまで20年以上かかりましたが、もう少し頑張れば腎臓を丸ごと作れそうな気がしています。今の自分があるのはあの時の新井先生の一喝のおかげです。先生にはとてもかないませんが、自分も少しはフェロモンを出せているでしょうか。もう一度あの頃に戻ってcalamariとprime rib steakを一緒に食べながら、そういう話をしてみたいです。Let’s start with calamari.